BeWiki
Неофициальный справочный ресурс для клиентов хостера BeGet
Cloudflare и Let's Encrypt
Перенёс сайт на DNS-сервера Cloudflare, теперь не получается перевыпустить сертификат Let’s Encrypt на хостинге. Как быть?
Если ваш домен делегирован на сервера Cloudflare, то и настраивать SSL нужно в личном кабинете на Cloudflare
Ссылка на инструкцию по настройке - https://support.cloudflare.com/hc/en-us/articles/200170516-How-do-I-add-SSL-to-my-site-
Вам подойдёт настройка “Flexible SSL”
Заказать сертификат Let’s Encrypt на хостинге без делегирования домена на DNS-сервера Beget’a не выйдет - Let’s Encrypt проверяет сверяет IP заказывающего сервера с DNS-записями.